{"id":39,"date":"2012-07-20T14:48:35","date_gmt":"2012-07-20T12:48:35","guid":{"rendered":"http:\/\/glub.sareanzehar.eu\/?p=39"},"modified":"2013-01-09T21:42:42","modified_gmt":"2013-01-09T20:42:42","slug":"variant-software-libre-cientifico-para-analizar-las-mutaciones-del-adn","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.glub.biz\/?p=39","title":{"rendered":"Variant: Software Libre cient\u00edfico para analizar las mutaciones del ADN"},"content":{"rendered":"<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"size-thumbnail wp-image-80 alignnone\" src=\"http:\/\/glub.abandonpod.es\/media\/images\/tux-paper-150x150.jpg\" alt=\"news\" width=\"60\" height=\"60\" \/><br \/>\n<strong>El programa bioinform\u00e1tico Variant, creado por investigadores del Centro de Investigaci\u00f3n Pr\u00edncipe Felipe en Espa\u00f1a(CIPF), analiza la parte del genoma que codifica prote\u00ednas, el exoma, e identifica las variables y mutaciones conocidas, cruza la informaci\u00f3n y realiza un informe de estimaci\u00f3n o predicci\u00f3n de las potenciales patolog\u00edas asociadas.<\/strong><\/p>\n<p><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"  alignnone\" title=\"ADN\" src=\"https:\/\/lh4.googleusercontent.com\/-svSVpP5JVhE\/UAlRywyD_bI\/AAAAAAAAAMg\/5pUea2Cd9Pg\/s240\/adn.jpg\" alt=\"ADN\" width=\"240\" height=\"240\" \/><\/p>\n<p>La mayor parte de los datos que se conocen en la actualidad sobre enfermedades humanas de origen gen\u00e9tico est\u00e1 incluido en el exoma. Como apunta Joaqu\u00edn Dopazo, director cient\u00edfico del CIPF, \u201ceste programa tiene capacidad para analizar de forma muy r\u00e1pida las variantes, asesorar al investigador sobre las que son conocidas, y establecer una predicci\u00f3n sobre aquellas variantes asociadas potencialmente a distintas enfermedades\u00bb.<!--more--><\/p>\n<p>Las particularidades del programa, descritas en la revista \u201cNucleic Acid Research\u201d (NAR), son la rapidez y actualizaci\u00f3n de los resultados y su buen funcionamiento. La gran potencia y velocidad del programa acorta los tiempos de procesamiento. \u201cLa aplicaci\u00f3n es capaz de procesar alrededor de 40.000 variantes, que es lo que se suele encontrar como promedio en un exoma humano, en menos de un minuto\u201d, explica Dopazo. Combina las ventajas de los programas remotos (instalados en un ordenador remoto), y las de los programas locales.<\/p>\n<p>Como expone Dopazo, \u201cse trata de un programa que no necesita instalaci\u00f3n ni ordenadores muy potentes, ya que f\u00edsicamente reside en un ordenador potente situado en el CIPF; pero funciona como uno local, ya que la respuesta es muy r\u00e1pida y eficiente\u201d. Asimismo, el programa, al ser remoto, utiliza bases de datos que siempre est\u00e1n actualizadas de acuerdo con los nuevos descubrimientos y asociaciones.<\/p>\n<p>En el genoma humano se han identificado miles de regiones de ADN asociadas con enfermedades. Las herramientas de an\u00e1lisis de datos de nueva generaci\u00f3n son imprescindibles para un estudio adecuado del genoma, ya que sin ellas no se pueden obtener conclusiones sobre los datos secuenciados. La mayor\u00eda de estas variantes identificadas se encuentran en bases de datos p\u00fablicas.<\/p>\n<p>De esta forma, Variant ha recopilado la informaci\u00f3n de todas las bases de datos de variantes y mutaciones y la ha puesto a disposici\u00f3n de la comunidad cient\u00edfica. \u201cFacilita el estudio de las variaciones gen\u00e9ticas en relaci\u00f3n con el riesgo de desarrollar cualquier enfermedad, con la predisposici\u00f3n e incluso con la resistencia a tratamientos\u201d, apunta Dopazo.<\/p>\n<p>Sin embargo, existen todav\u00eda lagunas y datos que han de ser completados antes de confirmar asociaciones de riesgo. Por ello, Variant pone a disposici\u00f3n del investigador una predicci\u00f3n de estas variantes desconocidas.<\/p>\n<p>Fuente:\u00a0<a href=\"http:\/\/www.aporrea.org\/internacionales\/n210141.html\">aporrea.org<\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>El programa bioinform\u00e1tico Variant, creado por investigadores del Centro de Investigaci\u00f3n Pr\u00edncipe Felipe en Espa\u00f1a(CIPF), analiza la parte del genoma que codifica prote\u00ednas, el exoma, e identifica las variables y mutaciones conocidas, cruza la informaci\u00f3n y realiza un informe de &hellip; <a href=\"https:\/\/www.glub.biz\/?p=39\">Sigue leyendo <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[6],"tags":[9,13,34],"class_list":["post-39","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-noticias","tag-adn","tag-ciencia","tag-mutaciones"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/39","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=39"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/39\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":239,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/39\/revisions\/239"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=39"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=39"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.glub.biz\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=39"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}